Définition
Espèce d’intérêt communautaire (EIC) : espèce considérée comme en danger, vulnérable, rare ou endémique (c’est-à-dire propre à un territoire bien délimité ou à un habitat spécifique) figurant ou étant susceptibles de figurer à l'annexe II et/ou IV ou V de la Directive Habitats-Faune-Flore et à l’annexe I de la Directive Oiseaux.
Cependant, seules les espèces inscrites à l’annexe II de la Directive Habitats-Faune-Flore et à l’annexe I de la Directive Oiseaux permettent la désignation d’un territoire en site Natura 2000.
Le site Natura 2000 de la Vallée de la Gartempe et ses affluents abrite 25 espèces d'intérêt communautaire (Directive Habitat-Faune-Flore) :
5 espèces de chauve-souris : Barbastelle d’Europe (1308) ; Petit Rhinolophe (1303) ; Grand Rhinolophe (1304) ; Murin de Bechstein (1323) ; Grand Murin (1324)
2 espèces de mammifères : Loutre d’Europe (1355) ; Castor d’Eurasie (1337)
4 espèces de poissons : Saumon atlantique (1106) ; Lamproie de Planer (1096) ; Lamproie marine (1095) ; Chabot fluviatile (5315)
3 espèces de mollusques : Moule perlière (1029) ; Mulette épaisse (1032) ; Vertigo moulinsiana (1016)
2 espèces de libellules : Agrion de Mercure (1044) ; Cordulie à corps fin (1041)
2 espèces de papillons de jour : Cuivré des Marais (1060) ; Damier de la Succise (1065)
3 espèces de coléoptères : Lucane cerf-volant (1083) ; Pique-prune (1084) ; Grand Capricorne (1088)
1 espèce de crustacé : Écrevisse à pieds blancs (1092)
1 espèce d’amphibien : Sonneur à ventre jaune (1193)
2 espèces de plantes : Hypne brillante (1393) ; Fluteau nageant (1831)
La rivière Gartempe abrite une exceptionnelle biodiversité. Ses berges boisées ont notamment permis le retour du Castor et de la Loutre. Les prairies humides à Molinie et les forêts de feuillus constituent des habitats de chasse, de repos et de reproduction essentiels aux chauves-souris forestières (hêtraies à houx et forêt de pente).
La rivière Ardour représente quant à elle le premier site de reproduction naturelle du Saumon atlantique (2002) depuis sa disparition du bassin de la Gartempe vers 1930. Son principal affluent, le Rivalier, présente les caractéristiques d'un cours d'eau de très bonne qualité. Il abrite notamment la Lamproie de planer et le Chabot.
Les gorges de la Couze à Balledent constituent aussi avec le secteur précédent un ensemble biologique cohérent, présentant des caractéristiques écologiques similaires.
La vallée de la Glayeule a été retenue pour sa richesse en zones humides et en espèces remarquables, comme le Castor et la Loutre d'Europe, ainsi que le Cuivré des marais, ou encore l'Agrion de Mercure.
La vallée de la Brame, de Magnac-Laval à sa confluence avec la Gartempe au Saut de la Brame, abrite plusieurs colonies de reproduction de Petit Rhinolophe. Leurs territoires de chasse autour des gîtes ont été retenus dans le périmètre Natura 2000. C'est un territoire remarquable au titre de ses prairies de fauche, riches en orchidées telles que la Sérapias langue, Serapias lingua, ou l'Orchis à fleurs lâches, Anacamptis laxiflora.